Theses and dissertations

Master
Computer Engineering
Title

Pulmonary nodule segmentation in computed tomography with deep learning

Author
Gomes, João Henriques Oliveira
Summary
pt
A deteção do cancro do pulmão numa fase inicial é essencial para o tratamento da doença. Sistemas de segmentação de nódulos pulmonares, usados em junção com sistemas de Deteção Assistida por Computador (DAC), podem ajudar médicos a diagnosticar e gerir o cancro do pulmão. Neste trabalho propomos um sistema de segmentação de nódulos pulmonares, recorrendo a técnicas de aprendizagem profunda. Aprendizagem profunda é um sub-campo de aprendizagem automática, responsável por vários resultados estado da arte em datasets de segmentação de imagem, como o PASCAL VOC 2012. O nosso modelo final é uma 3D U-Net modificada, treinada no dataset LIDC-IDRI, usando interseção sobre união como função de custo. Mostramos que o nosso modelo final funciona com vários tipos de nódulos pulmonares. O nosso modelo consegue resultados estado da arte no LIDC test set, usando nódulos anotados pelo menos por 3 radiologistas, com uma verdade consensual de 50%.
en
Early detection of lung cancer is essential for treating the disease. Lung nodule segmentation systems can be used together with Computer-Aided Detection (CAD) systems, and help doctors diagnose and manage lung cancer. In this work, we create a lung nodule segmentation system based on deep learning. Deep learning is a sub-field of machine learning responsible for state-of-the-art results in several segmentation datasets such as the PASCAL VOC 2012. Our model is a modified 3D U-Net, trained on the LIDC-IDRI dataset, using the intersection over union (IOU) loss function. We show our model works for multiple types of lung nodules. Our model achieves state-of-the-art performance on the LIDC test set, using nodules annotated by at least 3 radiologists and with a consensus truth of 50%.

Date

02-Apr-2018

Keywords

Computer vision
Machine learning
Cancro
Medical imaging
Pulmonary nodules
Image segmentation
Deep learning
Ciência da computação
Visão computacional
Tecnologia médica

Access

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