O Secretariado das escolas está inserido no Núcleo de Apoio Técnico-Administrativo que se encontra organizado em sub-unidades designadamente:
· Secretariado da Escola de Ciências Sociais e Humanas;
· Secretariado da Escola de Gestão;
· Secretariado da Escola de Sociologia e Politicas Públicas;
· Secretariado da Escola de Tecnologias e Arquitectura;
· Secretariado do Provedor do estudante e dos Conselhos Cientifico e Pedagógico.
Aos secretariados das escolas compete prestar todo o apoio técnico e administrativo necessário ao funcionamento eficiente e eficaz das Escolas e dos Departamentos que compõe cada escola, nomeadamente apoiando os docentes e alunos em procedimentos académicos e os órgãos das escolas e dos departamentos no seu funcionamento;
Ao Secretariado do Provedor do estudante e dos Conselhos Cientifico e Pedagógico compete prestar todo o apoio técnico e administrativo necessário ao funcionamento eficiente e eficaz destes órgãos.