Os órgãos do Departamento são o Director e a Comissão Científica.
O Director é coadjuvado por dois Sub-directores doutorados do departamento:
- Sub-directores:
- Carla Moleiro
- Joana Alexandre
A Comissão Científica é composta por:
- Director: Sven Waldzus
- Membros eleitos:
- Isabel Correia
- Paula Castro
- Manuela Calheiros
As competências dos órgãos encontram-se definidas no Regulamento do Departamento.