Os órgãos do Departamento são o Director e a Comissão Científica.
O Director é coadjuvado por dois Sub-directores doutorados do departamento:
- Sub-directores:
- Manuel Pita
- Luís Francisco Carvalho
A Comissão Científica é composta por:
- Director:Emanuel Leão
- Membros eleitos:
- Manuel Pita
- Luís Francisco Carvalho
- Raul Lopes